La flora está constituida especialmente por musgos, hierbas y líquenes, como la chunchuhuaita (que produce flores muy hermosas) y la pucamacashca (hierba que crece sobre las rocas de la Cordillera Blanca).
En esta región es fácil pasar del bosque virgen al pajonal. Son conocidas las plantas de Ayahuasca (que en runasimi quiere decir "la liana de la muerte"), el atunsisac (que es "la más grande de las flores" y a la que el naturalista inglés Lindley la llamó "Victoria Regia"), la castaña, la caoba y el jebe fino.
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